Hnízdí v dutinách stromů, snůška čítá 2-4 vejce v, inkubace trvá 28 dní. Samec zazdí samici se snůškou v hnízdní dutině. Úzkou štěrbinou krmí samici a následně i mláďata. Samice tak stráví téměř 3 měsíce zazděna v dutině stromu. Zoborožec naříkavý se ozývá výrazným voláním připomínajícím troubení.